raw file을 바꿔야 하는건지… fasta 불러오는 건 뭉텅이로 불러올 수 있고 거기서 description 추출해서 split으로 나눈 다음 학명 추출하는 것까진 했음. 근데 학명이랑 시퀀스를 싹 저장해야되는데 일단 얘가 하나만 저장하고…...
Continue reading...Python
나도! 나도 별찍기 할거야!
(일반적인 삼각형) (반대로 쏠린 삼각형) 이거 말하는 거 맞다. …정확히는 이건 기본형이고 저걸 카와이하게 가운데정렬 해야 하지만. 이렇게 했더니 무슨 마야문명 제단이 나와서 일단 다른 블로그를 검색해서 알아봤다. (주석에 참고문헌...
Continue reading...그 트리찍는게 가운데정렬이 빡시구만…
아니 그 세모를 일단 만들었음… 좌로쏠린거 우로쏠린거 역삼각형은 찍었는데요… 가운데정렬이 생각보다 빡세네… 공백을 양 옆으로 순차적으로 분배해야 하는데, 이걸 어떻게 해야 할 지도 애매하고… 다른 코드 참고해서 해봤는데 개판 오분전...
Continue reading...하이/로우 만들었다
일단 코드 자체는 그렇게 복잡한 건 없고… 카드 뽑을 때 숫자야구 리퍼런스에 있던 while문을 넣었다. (핸드 리스트에 있는 두 값이 같지 않을때까지 카드를 다시 뽑는 것) 그래서 중복 방지하고… if는...
Continue reading...아니 이러시는 이유가 있으실 것 아니예요
FASTA로 바꾼거 좋음. 셔준것도 좋다 이거야. 근데 왜 합계를 못 내요 합계를… 무슨 각개전투 하냐고… for문 떄려박고 리스트 떄려박아도 합계를 못내 왜… 배열도 한번 봐야되는게 pandas numpy 다 불렀는데 표...
Continue reading...아 이거 되게 애매하게 됐네..
원래 쿡북 한챕터 하고 블로그랑 미디움에 글까지 쓰는게 끝인데 MSA쪽에서 뭐가 안돼서 씨름하다가 시간 날림… 그거 아직 해결을 못봤는데 MSA쪽에서는 중요한거고(clustalw, muscle 쓰는거) 이게 되는건지 안되는건지도 모르겠어서 일단 더 알아봐야...
Continue reading...아니 전사번역에 코돈테이블은 너무 신박한데?
바이오파이썬 쿡북 보면서 하는중인데 이거 너무 신박한데? 아니 시퀀스 전사번역에 코돈테이블도 찾아주고 테이블도 바꿀 수 있는데 종류가 많아요 또 와 진짜 신박하네.. 근데 PTM은 안해줌? 저기 뒤에 가면 나오지 않을까
Continue reading...워우 Jupyter 쩐다!!
1. 표 가로를 안잘라줌(Pycharm은 묻따않 다 …로 잘라먹었음) 2. 경로 찾을 필요도 없음 걍 터미널에서 Jupyter notebook 치면 열림. 파이참은 다운로드 폴더 경로 가서 sh pycharm.sh 해야 됨… 3. 줄단위로...
Continue reading...Heatmap이 뭐 하는 그래프임?
어레이도 2차원으로 생성하고 그리는것도 네모네모고… 색깔 범위 이런거 지정할 수 있고… (scatter는 범위를 축 멕여서 지정하는데 얘는 값을 입력해버림) 이걸 내가 어디서 보긴 본 거 같음.. 알파폴드 논문인가에서 본 거...
Continue reading...그래프는 실전이었습니다
ChEMBL에서 데이터를 불러와서 HBA/HBD 산점도를 그렸음. 1. 결측값이 있어서 안되길래 dropna() 줘서 다 빼버리고(문제는 그렇게 빼버리면 못 쓰는 DB도 있음) 그래프를 그리니까 그려는 짐. 2. 이게 숫자인데 얘가 숫자로 인식을...
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